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如何对pcr结果进行分析?
更新时间:2024-11-12      阅读:377

一、PCR结果分析的基本步骤

1.基线设置‌:实时PCR反应的基线是指在PCR的初始循环期间的信号水平,通常是315个循环之间,此时荧光信号几乎没有变化,可以认为是背景或反应的噪音

2. 阈值设定qPCR的阈值代表的是明显超出基线的扩增信号水平,用以区分明确的扩增信号和背景。通常qPCR仪器自带软件会自动将阈值设置为基线荧光值标准偏差的10倍。

3. CT值计算Ct是指荧光信号超过阈值时对应的循环数,Ct值与目的基因的起始量成反比,可用于计算DNA初始拷贝数。

4. 扩增曲线分析:扩增曲线有两种展现形式,一种是线性,一种是对数形式。通常用CT来推算样品中样品的浓度,CT值越高说明模板浓度越低。

5. 标准曲线:将已知浓度的样品(标准品)经过梯度稀释后分别取样进行荧光定量PCR,得到的一系列Ct值与Log模板数对应可以得到一个相关的曲线,即标准曲线。这个标准曲线可以用来判断荧光定量PCR体系的优劣。

6. 熔解曲线分析PCR产物进行逐步升温监测,可以看到在达到其解链温度时,荧光信号会有一个忽然的下降。理论上如果PCR得到特异性产物则只有一个Tm值,在溶解曲线上表示只有单峰存在。如果是多相峰,可以判断产物不是单一的,发生了非特异扩增。

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二、不同PCR技术的结果分析方法

1. 第一代PCR技术:采用琼脂糖电泳的方式对PCR产物进行分析,通过电泳判断扩增产物的大小,用于临床检测。

2. 第二代PCR技术:荧光定量PCRqPCR),通过设置基线、阈值和CT值进行定量分析,适用于需要精确测量DNARNA含量的实验。

3. 第三代PCR技术:以微滴化处理步骤为主要特征,提高了检测的灵敏度和特异性,适用于更复杂的实验需求。


三、具体实验操作步骤

1. 样品处理:将样品进行稀释和离心处理,确保DNAwanquan裂解和分离。

2. PCR反应:按照试剂盒说明书操作,将反应管与冻干成分一起离心,添加缓冲液和引物/探针/核苷酸混合物,进行PCR反应。

3. 结果分析:通过基线、阈值、CT值和扩增曲线等参数分析PCR结果,比较实验组和对照组的差异,确定基因表达的变化。


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