继上文《一文了解tNGS》之后,今天我们讲讲它的“兄弟"——mNGS吧~
一、mNGS简介
mNGS(Metagenomic Next Generation Sequencing)是一种无需培养即可快速鉴定感染病原体的新技术,即宏基因组学二代测序技术,正在改变病原微生物检测的现状。它通过无需培养样本的方式,实现高通量、快速鉴定感染病原体,显著提高了检测的敏感性和特异性。其原理、优点和应用场景如下。
mNGS通过对临床样本的DNA或RNA进行高通量测序,无差别、无选择性地对样本中的核酸进行测序,然后与已知微生物数据库进行比对分析,从而判断样本中包含的病原微生物种类。这种方法不依赖于传统的微生物培养,也不需要进行特异性扩增,能够快速、客观地检测临床样本中的病原微生物。
1. 无偏倚、全覆盖:mNGS能够对检测样本中的所有生物基因组进行无偏倚测序,适用于常规手段无法检测到的病原微生物。
2. 高效性:mNGS能够在短时间内完成大量样本的测序和分析,大大提高了检测效率。
3. 无需培养:直接对临床样本进行核酸测序,避免了传统培养方法的时间和资源消耗。
4. 信息量大:mNGS不仅能检测已知病原体,还能发现新的病原体,对于新型病毒的迅速鉴定具有重要价值。
5. 多病原体检测:mNGS能够同时检测多种病原体,适用于多病原体引起的疾病。
1. 复杂感染:在经验治疗失败、复杂感染、不明原因的危重症、免疫缺陷等特殊患者人群中,mNGS是一种高效的病原体筛查方法。
2. 新发突发传染病:mNGS能够迅速鉴定新型病毒,为疫情防控提供重要支持。
3. 混合感染:mNGS能够检测混合感染,帮助医生更准确地制定治疗方案。
4. 药物选择:mNGS能够指导抗菌药物的精准选择,提高治疗效果。
mNGS技术在临床上的应用时间并不长,但发展迅速。第一例报道是在2014年的《New England Journal of Medicine》,随后在国内的临床应用也逐渐增多。随着技术的不断进步和成本的降低,mNGS有望在更多领域得到应用。