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PEG在核酸提取中的具体应用
更新时间:2024-10-21      阅读:43

一、PEG是什么?

     PEG,聚乙二醇是一种高分子聚合物,无刺激性,味微苦,具有良好的水溶性,并与许多有机物组分有良好的相溶性。具有优良的润滑性、保湿性、分散性、粘接性,可作为抗静电剂及柔软剂等使用,在化妆品、制药、化纤、橡胶、塑料、造纸、油漆、电镀、农药、金属加工及食品加工等行业中均有极为广泛的应用。其分子式为HO(CH2CH2O)nH,其中n代表聚合度,决定了PEG的分子量。PEG具有良好的水溶性、无毒性、生物相容性和化学稳定性,这些特性使得PEG在生物医学领域得到了广泛应用。

二、PEG在核酸提取中的作用机制

1、促进核酸凝聚

     PEG在核酸提取中的主要作用之一是促进核酸的凝聚。在高盐浓度(如NaCl)存在下,PEG能够与核酸分子相互作用,使核酸从水化的线状构象转变为紧凑的球状构象。这种构象转变暴露出核酸分子表面的负电荷磷酸基团,增加了核酸分子之间的静电相互作用,从而促进核酸的凝聚和沉淀。

2、增强核酸与固相载体的结合

     在核酸提取过程中,常常使用磁珠、硅胶等固相载体来吸附和纯化核酸。PEG的加入能够增强核酸分子与固相载体之间的结合力。具体来说,PEG能够通过与核酸分子表面的负电荷磷酸基团和固相载体表面的正电荷基团(如氨基)形成离子桥,从而牢固地将核酸分子吸附在固相载体上。

3、减少非特异性吸附

     在核酸提取过程中,除了目标核酸分子外,还常常存在许多非特异性成分(如蛋白质、多糖等)。这些非特异性成分可能会与固相载体结合,影响核酸的纯化效果。PEG的加入能够在一定程度上减少这些非特异性成分与固相载体的结合,提高核酸提取的纯度。

4、沉淀杂质

     PEG还能够在核酸提取过程中沉淀一些杂质成分,如细胞碎片、蛋白质等。这些杂质成分如果存在于核酸提取物中,会对后续的分子生物学实验产生干扰。PEG通过形成高分子凝胶状物质,将杂质成分包裹并沉淀下来,从而净化核酸提取物。

三、PEG在核酸提取中的具体应用

1、基于磁珠的核酸提取

     在基于磁珠的核酸提取方法中,PEG常作为重要的辅助试剂。具体步骤包括:首先,将待提取的样本(如血液、组织等)裂解,释放出核酸分子;然后,加入PEG和高盐溶液,使核酸分子凝聚并暴露出负电荷磷酸基团;接着,加入带有正电荷基团的磁珠,通过离子桥作用将核酸分子吸附在磁珠上;最后,通过磁场作用将磁珠与溶液分离,洗涤磁珠以去除杂质成分,最后洗脱磁珠上的核酸分子。

2、无醇清洗液中的应用

     在一些无醇清洗液中,PEG也作为重要的成分之一。这些清洗液主要用于去除核酸提取过程中的乙醇残留和其他杂质成分。PEG通过沉淀作用将杂质成分去除,同时避免了乙醇残留对下游实验的影响。这种无醇清洗液在xinguan病毒等病原体的核酸提取中得到了广泛应用。

3、片段化DNA的筛选

     在下一代测序(NGS)等高通量测序技术中,需要从样本中提取特定大小的DNA片段。PEG可以通过调节其浓度和反应条件,实现对不同大小DNA片段的选择性吸附和纯化。具体来说,通过两轮或多轮吸附过程,可以逐步去除较小或较大的DNA片段,最终得到符合要求的特定大小DNA片段。


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