DNA聚合酶是催化DNA或RNA为模板合成DNA的一类酶的总称,又称DNA依赖的DNA聚合酶(DNA—dependent DNA polymerase,DNA pol),它是以亲代DNA为模板,催化底物dNTP分子聚合形成子代DNA的一类酶。此酶是美国科学家Arthur Komberg于1957年在大肠杆菌中发现的,被称为DNA聚合酶Ⅰ(DNA polymerase Ⅰ,简称polⅠ)以后陆续在其他原核生物及真核生物中找到了多种DNA聚合酶。这些聚合酶的共同特点是:它们都能把脱氧核糖核苷酸(dNTP)连续的加到双链DNA引物链的3'-羟基末端上,催化核苷酸的聚合,形成新的DNA链。
PCR DNA聚合酶的种类包括Taq DNA聚合酶、高保真DNA聚合酶、热启动DNA聚合酶、等温扩增DNA聚合酶和链置换DNA聚合酶等。
一、PCR DNA聚合酶:
1. Taq DNA聚合酶
特点:Taq DNA聚合酶是从水生栖热菌中分离提取的,具有很高的热稳定性,能够在70℃保持活性,适合标准的PCR反应。它缺乏3’→5’核酸外切酶活性,因此无校正功能,容易产生错配碱基。
应用:用于常规PCR扩增,尤其是当对保真度要求不高时。其扩增产物3’末端带有A尾,可直接用于TA克隆。
2. 高保真DNA聚合酶
特点:这类酶具有3’→5’核酸外切酶活性,能够校正错误插入的核苷酸,显著降低错配率。常见的有Pfu、KOD、Phusion等。
应用:适用于需要高保真度的应用场景,如基因克隆、定点突变、测序及SNP分析等。例如,Hieff Canace® Plus High-Fidelity DNA Polymerase具有很高的保真性和扩增效率,适用于复杂模板的高保真扩增。
3. 热启动DNA聚合酶
特点:通过化学修饰或抗体结合,在室温下抑制其活性,直到高温激活。这种酶可减少非特异性扩增,提高PCR反应的特异性和灵敏度。
应用:适用于需要高特异性扩增的实验,如多重PCR、复杂模板的扩增等。例如,Hieff Union Hotstart High Specific Taq DNA Polymerase能够有效防止非特异性扩增,并提高扩增特异性。
4. 等温扩增DNA聚合酶
特点:这类酶具有链置换活性和5’→3’聚合酶活性,能在恒温条件下进行快速、高效、特异性扩增。
应用:适用于等温扩增技术,如LAMP、CPA、RCA等。例如,Bst Ⅱ Plus DNA Polymerase具有更高的灵敏度、扩增效率和稳定性,且增加了dUTP耐受性,非常适合基于等温扩增技术的应用。
5. 逆转录DNA聚合酶
特点:这类酶以RNA为模板,按5’→3’方向合成互补DNA(cDNA),常用于研究基因表达。
应用:用于将RNA转录为DNA,如RT-PCR、qRT-PCR等。常用的逆转录酶包括M-MLV和AMV。
6. 链置换DNA聚合酶
特点:具有强链置换活性,可以在DNA复制过程中取代旧链,常用于等温扩增技术。
应用:适用于基于链置换的等温扩增反应,如LAMP和滚环扩增(RCA)。例如,Bca best聚合酶和phi29 DNA聚合酶在扩增速度、产量和热稳定性方面都有优异的表现。
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